By this author

AP-site does not introduce significant distortions into the DNA structure in the nucleosomes in vitro

Issue number 8 from 04.08.2025

Повреждения ДНК приводят к искажению структуры В-формы её двойной спирали. Узнавание подобного искажения белками репарации ДНК является важным этапом инициации этого процесса. Структура нуклеосомы накладывает ограничения на мобильность и пластичность геометрии ДНК в своём составе. При изучении взаимодействий репарационных белков с ДНК в составе нуклеосомы основной вопрос заключается в реализации структуры ДНК, характерной для самого повреждения в конкретном контексте. Кроме того, ДНК-дуплекс в составе нуклеосомы имеет регулярный профиль контактов с гистонами, соответствующий шагу спирали ДНК. По изменению этого профиля можно судить об изменениях структуры ДНК. Этот профиль коррелирует с доступностью соответствующих нуклеотидов для взаимодействия с ДНК-связывающими белками. В нашей работе методом футпринтинга было показано, что наличие апуринового/апиримидинового сайта в пределах второго-третьего витка спирали от 5'-конца в составе нуклеосомной ДНК не оказывает существенного влияния на профиль контактов ДНК с гистонами.

88 0