Количественный анализ транскрипции генов широко применяется в различных областях биологии, а в медицине - используется для диагностики и получения транскриптомного профиля заболеваний (транскриптомного профилирования). В последнее время большой популярностью пользуются методы исследования транскриптомов с применением масштабного секвенирования нового поколения. Транскриптомные исследования позволяют устанавливать, какие клеточные процессы активны в тот или иной момент времени, выявлять динамику транскриптома в различных тканях или состояниях, например во время онтогенеза или при физиологической адаптации, а также выявлять дифференциально экспрессирующиеся гены в случае заболевания. Выраженное изменение уровня транскрипции одного или нескольких генов при патологическом состоянии может быть достаточным для диагностики, то есть может служить транскрипционным биомаркером заболевания. Однако в ряде случаев изменение уровня транскрипции может быть индикатором мутаций, в том числе ведущих к нарушению сплайсинга, транскрипционной активности мобильных элементов и псевдогенов. В обзоре рассмотрены случаи, в которых уровень транскрипции может оказаться полезным для выяснения генетических причин заболевания, а также обсуждены проблемы, которые следует учитывать при использовании транскрипции в качестве диагностического маркера. В перспективе можно ожидать, что специализированные таргетные панели, основанные на анализе транскрипции, будут использоваться не только в качестве диагностического и прогностического инструмента, но и в качестве предиктора структурных нарушений генома, что будет способствовать разработке новых стратегий эффективного лечения заболеваний.
Indexing
Scopus
Crossref
Higher Attestation Commission
At the Ministry of Education and Science of the Russian Federation