Циклические РНК (циклоРНК) - ковалентно замкнутые некодирующие РНК, обладающие повышенной метаболической стабильностью и способные к регуляции экспрессии генов. ЦиклоРНК рассматриваются как потенциальные биомаркеры и мишени терапии для различных заболеваний, в том числе для ишемического инсульта. Модель обратимой окклюзии правой средней мозговой артерии (tMCAO) активно используется в транскриптомике инсульта. В настоящей работе с помощью полногеномного РНК-секвенирования мы изучили профиль экспрессии циклоРНК в участке фронтальной коры мозга крыс через 24 ч после tMCAO. Мы идентифицировали 64 дифференциально экспрессированных циклоРНК (кратность изменения > 1,5; Padj < 0,05), которые преимущественно повысили свой уровень экспрессии относительно ложнооперированных животных. По данным МРТ, изучаемый участок фронтальной коры включал зону пенумбры, выживание клеток в которой имеет важное значение для восстановления после инсульта. Также, используя ранее полученные нами данные о дифференциальной экспрессии мРНК в данной области мозга, мы биоинформатически спрогнозировали регуляторные сети циклоРНК-микроРНК-мРНК. Функциональный анализ данных сетей показал, что гены, экспрессия которых может зависеть от активности циклоРНК при ишемии, ответственны за синаптическую передачу сигналов и воспалительную реакцию. Наше исследование показывает значимую роль циклоРНК-опосредованной регуляции транскриптома в ассоциированной с пенумброй области мозга при ишемии и позволяет рассматривать циклоРНК как потенциальные мишени для новых стратегий терапии инсульта и постинсультных осложнений.
Indexing
Scopus
Crossref
Higher Attestation Commission
At the Ministry of Education and Science of the Russian Federation