By this author

Influence of in situ limited proteolysis of potato virus X on change in the structure of virions according to data small-angle X-ray scattering and tritium labeling

Issue number 3 from 18.03.2026

Вирусные капсиды семейства потексвирусов характеризуются наличием на поверхности вирионов частично неупорядоченных N-концевых фрагментов белков различной протяжённости. Настоящее исследование посвящено изучению влияния in situ удаления N-концевого домена белка оболочки (БО) на структурную организацию и физико-химические свойства вирионов X-вируса картофеля (ХВК). В работе рассматриваются вирионы ХВК, содержащие интактную Ps-форму БО, а также вирионы, включающие in situ деградированную Pf-форму, лишённую 19/21 аминокислотных остатков с N-конца (ХВКΔN). Для изучения применялись методы синхротронного малоуглового рентгеновского рассеяния (МУРР), просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ), тритиевой бомбардировки и ряд других физико-химических методов. Анализ изображений, полученных методом ПЭМ, выявил сходство архитектуры нитевидных вирионов ХВК и ХВКΔN. Результаты МУРР продемонстрировали различия в организации капсидов вирионов ХВК и ХВКΔN: для последних характерно сокращение размеров упорядоченных областей, что свидетельствовало о частичном нарушении структуры белкового каркаса вируса. Кроме того, по кривым рассеяния МУРР были рассчитаны параметры спиральной упаковки вирионов в растворе и выполнено структурное моделирование частиц. Результаты моделирования также указывают на изменения в структуре капсидов вследствие удаления ΔN-пептида. С использованием информации о вторичной структуре модели ХВК (PDB ID: 6R7G) и данных наших предыдущих исследований по тритиевому мечению поверхностных участков вирионов ХВК и ХВКΔN был проведён сравнительный анализ профилей включения метки в элементы вторичной структуры белка. С помощью данного подхода удалось предсказать локализацию ΔN-пептида над остатками аминокислот соседних субъединиц спирали (122–129 и 143–153) и показать стабилизирующее влияние этого пептида на структуру вириона в целом. Увеличение уровня метки в C-концевой области после удаления ΔN-пептида также свидетельствует о снижении компактности вириона. В целом, полученные знания будут полезными при использовании вирусоподобных наночастиц в биотехнологии.

20 0